Der Dom hat zwei Krypten, eine Westkrypta und eine Ostkrypta. Sie sind miteinander verbunden. Die Westkrypta ist der älteste erhaltene Teil des Doms und stammt aus der Zeit um das Jahr 1000. In der östlichen Altarnische steht eine Madonnenfigur aus der Spätromanik. In der westlichen Altarnische befindet sich ein Altar, der noch aus dem karolingischen Dom stammt (8.–9. Jahrhundert). Die östliche Krypta, auch vordere Krypta genannt, ist deutlich größer und wurde im 12. Jahrhundert errichtet. Auch in dieser Krypta stand einst ein Altar. Die im vorderen Bereich der Krypta erhaltenen Fresken (Deckenmalereien) stammen aus der Spätromanik, bzw. der Frühgotik.
Grundriss vom heutigen Dom (schwarz) mit Lage des ersten Doms aus dem 8. / 9. Jahrhundert