Der größte Schatz der Kirche ist die Orgel. Sie wurde im Jahr 1607 von dem damaligen Kopenhagener Hoforgelbaumeister Nikolaus Maas errichtet. In den Jahren 1707 bis 1709 baute der bedeutende Orgelbaumeister Arp Schnittger die Orgel um. In dieser Zeit erhielt sie ihr heutiges Aussehen. Besonders der reich verzierte Orgelprospekt ist wunderschön.